VZL 2009, 78(4):154-157

Spatial Reconstruction of Histological Sections of the Temporal Bone

Bruno Ježek1, Viktor Chrobok2, Karel Antoš1, Jan Vaněk1
1 Univerzita obrany, Fakulta vojenského zdravotnictví, katedra veřejného zdravotnictví, Hradec Králové
2 Pardubická krajská nemocnice, a. s., Pardubice

Technický rozvoj v oblastech počítačového hardwaru a aplikace nových zobrazovacích algoritmů umožňuje nasazení prostorových vizualizačních metod i v oblastech biologického výzkumu. Počítačová grafika a metody vizualizace informace se stávají významným pomocníkem při zkoumání prostorových charakteristik objektů v medicíně. Článek popisuje proces počítačové vizualizace zkoumaných objektů, používané metody, datové struktury a softwarové nástroje. Na případové studii vizualizace spánkové kosti je ukázán postup rekonstrukce od snímání rastrových obrazů až po výsledné zobrazení vytvořeného počítačového modelu. Dosažené výsledky ukazují možnost kombinování rovinných, povrchových i objemových vizualizačních metod pro různé zkoumané objekty.

Keywords: Vizualizace informace; Prostorová vizualizace lékařských dat; Voxelový model; Registrace; Spánková kost; MeVisLab

Technical development in computer hardware and application of new visualization algorithms allow the use of spatial visualization methods in many different branches of biological research. Computer graphics and information visualization methods became important help in the research of spatial features of medical objects. The article describes the process of studied objects visualization, used methods, data structures and software tools. Temporal bone visualization case study shows reconstruction process from acquired image data to final rendering of created computer model. Obtained results prove the possibility to combine image, surface and volume visualization methods for different researched objects.

Keywords: Information visualization; Medical data rendering; Voxel model; Registration; Temporal bone; MeVisLab

Received: February 20, 2009; Published: December 1, 2009  Show citation

ACS AIP APA ASA Harvard Chicago Chicago Notes IEEE ISO690 MLA NLM Turabian Vancouver
Ježek, B., Chrobok, V., Antoš, K., & Vaněk, J. (2009). Spatial Reconstruction of Histological Sections of the Temporal Bone. Vojenské Zdravotnické Listy, 78(4), 154-157
Share...
Download citation
  • BibTeX (.bib)
  • Bookends (.ris)
  • EasyBib (.ris)
  • EndNote (.enw)
  • EndNote 8 (.xml)
  • ISI WoS (.isi)
  • Medlars (.medlars)
  • Mendeley (.ris)
  • MODS (.xml)
  • Papers (.ris)
  • RefWorks (.txt)
  • RefManager (.ris)
  • RIS (.ris)
  • MS Word (.xml)
  • Zotero (.ris)
    • Open full article

    References

    1. BITTER, I. - VAN UITERT, R. - WOLF, I., et al. Comparison of Four Freely Available Frameworks for Image Processing and Visualization That Use ITK. IEEE Transaction on Visualization and Computer Graphics, 2007, vol. 13, no. 3, p. 483-493. Go to original source... Go to PubMed...
    2. GERSHON, N. - EICK, SG. - CARD S. Information Visualization. ACM Interactions, 1998, vol. 5, no. 2, p. 9-15. Go to original source...
    3. CHROBOK, V. - ŠIMÁKOVÁ, E. - MELOUN, M. - JEŽEK, B. Embryonální vývoj a vrozené malformace třmínku. Otorinolaryngologie a Foniatrie, 2003, roč. 52, č. 3, s. 119-126.
    4. CHITTARO, L. Information Visualization and its application to medicine. Artificial Intelligence in Medicine, 2001, vol. 22, p. 81-88. Go to original source... Go to PubMed...
    5. JEŽEK, B. - ANTOŠ, K. - CHROBOK, V., et al. Registration of image medical data. In Proceedings WSCG' 99. Plzeň, UNION Agency, 1999, s. 68-73. ISBN 80-7082-490-5.
    6. JEŽEK, B. - ANTOŠ, K. Improved Gradient Estimation Methods for Rendering of Volume Data. In WSCG' 2003. Posters proceedings. Plzeň, UNION Agency, 2003, p. 61-64. ISBN 80-903100-2-8.
    7. JEŽEK B. - VANĚK J. - CHROBOK V., et al. Vizualizace nejen medicínských dat systémem MeVisLab. In Sborník příspěvků 28. konference o geometrii a grafice. Brno, MZLU, 2008, s. 137-145. ISBN 978-80-7375-249-1.
    8. MeVisLab: Medical Image Procesing and Vizualization [online]. MeVis Medical solutions. [cit. 2009-02-03]. <http://www.mevislab.de/>.
    9. SNEIDERMAN, B. The eye have it: a task by data type taxonomy for information visualizations. Proceedings of the IEE Symposium on Visual Languages'96, 1996, p. 336-343.
    10. ŠONKA, M. - HLAVÁČ, V. - BOYLE, R. Image Processing, Analysis, and Machine Vision. 1. vyd. PWS Publishing, 1998. 770 s. ISBN 978-0495082521.
    11. The Visible Human Project [online]. United States National Library of Medicine. [cit. 2009-02-03]. <http://www.nlm.nih.gov/research/visible/visible_human.html>.

    Return to the content